蒙古國位於中俄之間的蒙古高原上，境內有河流3800條，總長度達6.7萬公里，平均年徑流量爲390億立方米，有3500個湖泊，7000多處泉眼，湖泊水資源量達1800億立方米。全國99%的河流全部流向俄羅斯，南部接壤的中國除了東流黑龍江的克魯倫河（最終還成爲中俄界河），西部幾條小支流匯入額爾齊斯河（最終還是流入俄羅斯），其餘再無河流流向中國。
主要河流有色楞格河、鄂爾渾河、克魯倫河和科布多河等50多條大河，大部分分佈在北部、中部地區。湖泊大多分佈在西北地區，主要湖泊有烏布蘇湖、庫蘇古爾湖、吉爾吉斯湖和哈拉烏蘇湖。南部則河流、湖泊很少。
色楞格河源於蒙古杭愛山北坡，稱爲伊德爾河，流經蒙古北部，注入俄羅斯貝加爾湖，是葉尼塞河—安加拉河的源頭之一。全長1024千米，流域面積945480平方千米。哈努依河和鄂爾渾河從右岸注入，德勒格爾河和額吉河從左岸注入。水流湍急，河牀落差爲720米。自河口可通航到蘇赫巴託市。10-11月開始結冰，次年4-5月解凍。流經蒙古重要的農牧經濟地區。該河流向東北，與鄂爾渾河匯合於蘇赫巴托爾，繼續北流，進入俄國境內轉向東，到達布里亞特首府烏蘭烏德。河水從此處向北流到塔陶羅沃，再向西彎轉，流經一片三角洲，注入貝加爾湖。
鄂爾渾河蒙古北部河流，色楞格河最大支流，蒙古國最長的河流。發源於杭愛山脈森林茂盛的山坡，流向東北，在接近國境處與色楞格河匯合，注入俄羅斯境內的貝加爾湖。全長1124千米，流域面積13.8萬平方千米，支流衆多。
克魯倫河是呼倫湖（達賚湖）支流，因湖水透過以達蘭鄂羅木河同額爾古納河上源海拉爾河相聯進入黑龍江，所以克魯倫河屬於黑龍江水系。發源於蒙古國的肯特山東麓。在中游烏蘭恩格爾西端進入中國境內。流經呼倫貝爾盟新巴爾虎右旗，東流注入呼倫湖。全長1264公里，在中國境內206公里。成吉思汗所出的蒙古乞顏部以及塔塔兒部、弘吉剌部的原始駐牧地就在克魯倫河流域，故它又有“蒙古人母親河”之稱。兩岸爲半荒漠的低山圍繞，河谷寬約35公里，河寬70米。兩岸沼澤溼地多，較高的階地上生長着優良牧草，牧業發達。上游用於灌溉，流送木材，沿岸牧草豐富，自古爲重要農牧業地帶
