新中國成立後，1980年，新疆維吾爾自治區人民政府批准設立喀納斯自然保護區。1986年，經國務院批准，確定爲國家級自然保護區，隸屬新疆維吾爾自治區林業廳管理，設管理處。2000年成立“喀納斯環境與旅遊管理委員會”與“喀納斯國家級自然保護區管理局”，機構隸屬布爾津縣。
2003年喀納斯管理機構上劃阿勒泰地區，改“喀納斯環境與旅遊管理委員會”爲“喀納斯環境與旅遊管理局”，對該地域資源的開發、利用和保護實行統一管理。
2006年7月，阿勒泰地委、行署決定成立了中共喀納斯景區委員會和喀納斯景區管理委員會，明確了喀納斯景區10030平方公里的大旅遊管轄區域，並將布爾津縣的禾木哈納斯蒙古民族鄉、哈巴河縣的鐵熱克提鄉劃歸景區管委會統一管轄。
