根據與司法、衛生行政部門及醫療糾紛人民調解委員會（簡稱醫調會）的合作深入程度，以及對醫療責任風險的管控力度，保險公司可採用自主理賠和合議理賠兩種處理模式。
自主理賠模式，即以保險公司爲主導的理賠模式，保險理賠人員直接面對醫療機構及患者，對醫療損害事故賠償的準確性及合理性（包含醫療責任認定、損失覈定、賠償標準等）進行審覈，主導醫療責任保險理賠全程處理工作。
合議理賠模式，即以保險公司與醫療事故調解委員會等第三方調解機構共同管理的理賠模式，透過向醫調會等第三方調解機構派駐保險理賠人員，積極介入醫療責任事故處理，主動會同相關部門開展醫療損害事故責任認定和賠償處理工作，實現醫療責任保險理賠處理的全程跟蹤和管理。
