醫院的合同制與勞務派遣的主要區別在於用工形式上的差別。合同制員工是醫院直接從社會上招聘而來，並簽訂勞動合同，以合同工的方式與醫院建立勞動人事關係勞務派遣是由社會上勞務派遣公司派遣的勞務工，與醫院沒有勞動人事關係，也不需要簽訂勞動合同，其勞動人事關係是在勞務派遣公司的。
醫院合同制與勞務派遣的主要區別在於兩者的福利待遇不一樣。對於醫院而言，合同制員工就是自己人，可以享受醫院裏面的各種福利待遇，按照合同寫的得到工資。而勞務派遣的人醫院只需要提供工資，不需要管他們的生活保障等等其他福利
醫院合同制是與所在醫院簽訂勞動合同關係，而勞務派遣是與第三方公司既勞務派遣公司簽訂勞動合同關係。
按照國家規定，醫院合同制籤訂的合同與醫院在編人員簽訂的合同只是在編志上有所區別，其它相同。
而勞務派遣簽訂的合同在醫院工作，但工資，保險等均有勞務派遣公司負責，醫院不承擔這方面的責任
