祖源不同，分佈區域不同，是蘭陵蕭氏和廬陵蕭氏主要區別。
蘭陵蕭氏是指山東臨沂的蘭陵，是一顯赫的望族。廬陵蕭氏並非蘭陵蕭氏，系出南蘭陵蕭氏，最真實的祖先是東晉的蕭整。廬陵蕭氏之所以追尊蘭陵蕭氏，有攀附之意。如此，則蕭何家族、蘭陵蕭氏、廬陵蕭氏爲三個不同出處的蕭氏。蕭氏父系南齊蕭道成、南樑蕭衍疑似爲O1b1-F14965下游。如何確定廬陵蕭氏不是蘭陵蕭氏最明顯的一點，廬陵蕭氏的後裔都分佈在南方，尤其是江西，和蘭陵蕭氏不符。廬陵蕭氏形成於2400年前，而蕭何活躍在2200年前，時間對不上。廬陵蕭氏是蕭何後裔的可能性不高，除非能證明蕭何後裔都去了南方。但蕭何後裔被封爲酇侯，在中原一帶。
