由海洋生物羣落和海洋環境兩大部分所組成。
系統一詞來源於英文system的音譯，即若干部分相互聯繫、相互作用，形成的具有某些功能的整體。中國著名學者錢學森認爲：系統是由相互作用相互依賴的若干組成部分結合而成的，具有特定功能的有機整體，而且這個有機整體又是它從屬的更大系統的組成部分。
1、我國擁有海洋生態系統有濱海溼地生態系統、珊瑚礁生態系統、上升流生態系統和深海生態系統。
2、濱海溼地生態系統：按國際溼地公約的定義，濱海溼地的下限爲海平面以下6米處（習慣上常把下限定在大型海藻的生長區外緣），上限爲大潮線之上與內河流域相連的淡水，或半鹹水湖沼以及海水上溯未能抵達的入海河的河段。
3、上升流生態系統：在上升流海域由特定的生物及周圍的環境構成，食物鏈較短、生產力很高的生態系統。
4、珊瑚礁生態系統：珊瑚礁被稱爲海洋中的“熱帶雨林”是海洋生態系統的重要組成部分。它以不到海底的千分之二的覆蓋面積，爲近30%的海洋魚類提供了生活的家園。
5、深海生態系統：深海中缺乏陽光，靜水壓力大，形成黑暗、低溫和高壓的環境。由於不能進行光合作用，深海生態系統中沒有光合作用的植物，沒有植食性動物，只有碎食性和肉食性動物、異養微生物和少量濾食性動物。人類已發現的深海生態系統包括：深海海山生態系統、深海化能合成生態系統、深淵生態系統、海底火山生態系統和海底湖泊生態系統等。
海洋生態系統主要是由海洋生物羣落和海洋環境兩大部分所組成，而且每一部分又包括有衆多要素。
分析一下，這些要素主要有6類：
1、自養生物，是生產者，主要是具有綠色素的能進行光合作用的植物，主要包括浮游藻類、底棲藻類和海洋種子植物還有可以進行光合作用的細菌。
2、異養生物，是消費者，包括各類海洋動物。
3、分解者，主要包括海洋細菌和海洋真菌。
4、有機碎屑物質，主要包括生物死亡後分解成的有機碎屑和陸地輸入的有機碎屑等，以及大量溶解有機物和其聚集物。
5、參加物質循環的無機物質，例如碳、氮、硫、磷、二氧化碳、水等。
6、水文物理狀況，例如溫度、海流等。
