通常由船方承擔。港口使用費按着停靠時間計算，港口依據交通部的檔案有明確的標準。除此之外，船方還要繳納港口建設費，港口建設費的徵收對象爲經對外開放口岸港口轄區範圍內所有碼頭、浮筒、錨地、水域裝卸的貨物。
港口所在地海事管理機構具體負責本港口轄區內港口建設費的徵收工作。
按作業性質可分爲生產性停泊費和非生產性停泊費而生產性停泊費按船舶的性質又分爲內貿生產性停泊費和外貿生產性停泊費。
對停泊在碼頭和浮動進行裝卸作業的船舶停泊費費率爲0.20元/淨噸(馬力)/日對停泊在港口錨地的船舶停泊費費率爲0.05元淨噸(馬力)/日。船舶在同一航次內，多次掛靠我國港口，停泊費在第一港按實際徵收外，以後的掛靠港口給予30%的優惠。對下列停泊在碼頭的船舶停泊費費率爲0.15元/淨噸(馬力)/小時。
到港口裝貨的船舶只要不是船舶的原因造成滯期，不收取船舶停靠費，由於貨代船代貨主等原因造成滯期的，不光是繳納每日每噸位1000$停靠費以外，還要繳納港口作業損失費。
