雲南雨水主要是由來自印度洋的溼潤西南季風帶來的降雨。受到厄爾尼諾現象的影響，導致東亞季風環流受到影響，印度洋的西南季風較往年較弱，雲南低緯高原的特殊地貌，水汽更加難以進入，降水嚴重減少，地下水下滲嚴重，地表水流失快， 近年來的植被破壞，加劇地表蒸發等多因素影響，都會導致雲南乾旱。
雲南的雨水來源有兩不分。一部分是西南季風攜帶印度洋的水汽在滇西的橫斷山西側受地形擡升形成降水。而滇東的水汽主要來自太平洋，被東南季風攜帶至此形成降水。
雲南西南部爲熱帶季風氣候，成因主要是氣壓帶及風帶的季節移動造成的（南半球的東南信風越過赤道後偏轉成西南季風），其次還有海陸熱力性質的差異。降雨集中在6-9月，雲南其它地區都是亞熱帶季風氣候。
