（1）赤潮生物是引發赤潮的內在因素，有赤潮生物的存在是發生赤潮的前提
（2）海水富營養化是赤潮生物快速繁殖的物質基礎和首要條件，大量工農業廢水、生活污水和養殖廢水排入海洋，海水中氮、磷、硅等營養鹽，水溫、鹽度、微量金屬元素以及維生素類等含量大大增加，導致近海、河口、港灣富營養化程度日趨嚴重，赤潮頻發
（3）水文氣象和海水理化因子是赤潮發生的重要原因，尤其海水溫度是赤潮生物繁殖的重要條件。天氣形勢穩定，風力較小、陽光充足、適宜的水溫和鹽度是赤潮生物大量繁殖的有利條件。海潮流緩慢、水體交換弱，穩定的水文環境條件利於赤潮生物聚集。
