小瓜蟲的天敵是輪蟲，我每年在魚苗下塘之前，我都會培育大量輪蟲，一是供魚苗開口餌料，二是可以成爲小瓜蟲的天敵，抑制小瓜蟲。
另外還有一種中藥（青蒿），可以內服，魚苗吃了以後魚苗身上就有一點氣味，小瓜蟲就不會叮咬魚苗，這樣就可以預防小瓜蟲。同時提醒大家，待小瓜蟲全部脫落以後，一定要消毒。小瓜蟲雖然掉了，但是魚苗身上還是會有一個叮咬小孔，如果不消毒的話，還是會感染細菌，還是會死掉。
最大的天敵是高溫和鹽。
小瓜蟲屬原生動物門、纖毛蟲綱、凹口科、小瓜蟲屬，主要寄生在魚類的面板、鰭、鰓、頭、口腔及眼等部位，形成胞囊呈白色小點狀，肉眼可見。嚴重時魚體渾身可見小白點，故稱白點病。它引起體表各組織充血，魚類感染小瓜蟲後不能覓食，加之繼發細菌、病毒感染，可造成大批魚死亡，其死亡率可達60%～70%，甚至全軍覆沒，對養殖生產帶來嚴重威脅
小瓜蟲經常出現的地方都是在魚類的口腔，眼部和麪板等地方，外觀看上去就是白色的小點狀，肉眼清晰就能看到，一旦發現之後需要及時去處理才行，那麼小瓜蟲天敵是什麼呢
小瓜蟲的天敵，可以把水溫快速加熱到三十度，它無法更好抵抗住高溫，從而加快它的生長速度，在最短的時間內從魚體的表面上脫落下來。
或者使用5%的鹽水，然後把魚放在裏面浸泡幾天，這樣也能快速殺死小瓜蟲。
或者還能把魚類放在甲基藍溶液之中浸泡，要事先做好稀釋，大概是百萬分之二左右，每天浸泡六個小時即可。
