1、將進、出口水管及排油管接好，關閉排污閥及出水球閥，進水管接污水槽，開啟進水閥。
2、啓動泵源開關，依次開啟預過濾器、聚結過濾器上的排氣(油)閥，待排氣(油)閥有水溢出時，表明該腔體內已充滿水，此時關閉該排氣閥，待各腔體均充滿水時，開啟出水球閥。也可以透過電磁閥手動排氣，排氣過程一般只需在在設備剛開始工作時進行，設備正常執行
後不需排氣。根據出水水質情況，可以透過出水閥適當調節進水流量的大小，出水水質差可減小流量，反之可增大流量。
3、系統進入正常工作狀態，此時清水從出水口排出，集油室開始集油，油水介面開始下降。當油浸沒住傳感器的電極棒時，傳感器輸出信號，電磁閥處於開通狀態，排油電磁閥開始排油，此時相應的電磁閥指示燈亮，當排油控制箱設定的延時時間到時，排油電磁閥關閉。
排油指示燈熄滅，排油結束。排油後，油水介面開始上升，電極棒處於水中時，傳感器停止輸出信號，從觀察窗上可以觀察油位高低。
4、每次停機前應將清水注滿水-油分離器各腔體並關閉進、出水球閥。若長時間停機不用，應在停機前以清水執行20分鐘，直至存油全部從水油分離器內腔排出。
