反覆用清水洗淨後，用筷子將一頭抵住，把它從裏到外翻過來，然後放在案板上，取一把快刀，開始刮腸。
刮腸難度最大，下手要穩、準、狠，要以迅雷不及掩耳之勢，幾下子就將腸液及雜物刮盡，又不傷腸肉。將刮好的大腸放入淨水鍋中煮八成熟後撈出，加少許鹽面、玉米麪及醋汁幾滴，反覆用雙手揉搓、沖洗，直至無一點異味。
很簡單，放放在水裏煮就行了，煮的過程中要注意：水一開就要拿筷子或者牙籤刺破馬腸子，多次幾個洞，以防爆炸，會濺得到處都是油，大概煮2小時左右就熟了，涼了就可切塊吃了。這是最正宗的。
如果是真空包裝的，就是罐頭，那不是真正的馬腸子，只有新疆以外的人才吃。開啟包裝就可以吃。如果是生的，按上面的做法做就行了，還有種做法，就是把馬肉切成那個小塊，加上洋蔥末放入馬肉湯裏煮一下，澆在剛下出的麪條上，這叫納仁。不過麪條最好是手擀麪
