都是市，但大有不同。區別有二：
一是行政級別不同，南平市是地級市，下轄兩區、八縣（市），位於福建省的北部，簡稱閩北，其中包含雙世遺的武夷山。武夷山市原來叫崇安縣，撤縣建市才改稱現名，只是個縣級市。
二是功能差別不同，南平市是閩北政治、文化和經濟發展中心，武夷山市是旅遊名勝地和巖茶主產區。
南平市是褔建省的一個地級市，而武夷山市是福建省南平市屬下的一個縣級市，歸屬於南平市。武夷山市是南平市的一個縣級市。南平是福建轄區面積最大的設區市，轄二區三市五縣，即延平區、建陽區、邵武市、建甌市、武夷山市、順昌縣、浦城縣、光澤縣、松溪縣、政和縣。
武夷山市是縣級市，屬於南平管轄，以旅遊業爲主，常住人口不多。市內的武夷山風景區全國聞名。南平是地級市，下面還管着兩區三市多縣，以工業爲主，以前的南孚，南鋁，南紡都是有名的企業，常住人口也多且密集。
