主流洪水期大致始於10至11月，次年3至6月進入最高洪水期，6月以後逐漸減退，至9月最低。個別年份因雨季變動而使南北支流洪水同時發生，主流便出現特大洪峯，如奧比杜斯附近曾記錄到每秒280000的流量。
由於中、下游平原地勢低，河流比降微緩，流速較慢，一到洪水季節河水宣泄不暢，水位平均上漲幅度9米多，洪泛寬度25至80公里，河口地區可達240公里，呈現一片汪洋，因此亞馬遜河素有“河海”之稱。
亞馬孫河南岸支流洪水期在11月至次年5月，北岸支流洪水期在3～8月。亞馬孫河的涌潮可沿河上溯1000多千米。亞馬孫河因爲位於熱帶雨林地區，氣候是熱帶雨林氣候，全年高溫多雨，沒有明顯的汛期，這就導致了亞馬孫河沒有明顯的漲潮時間。
但是汛期也有，亞馬遜河流域地跨赤道，由於赤道附近多雨地區，亞馬遜水量終年充沛，流域內降水季節變化較小，主流洪水期大致始於10至11月，次年3至6月進入最高洪水期，6月以後逐漸減退，至9月最低。
