有氧呼吸的主要場所是線粒體。有氧呼吸是指細胞或微生物在氧的參與下，透過多種酶的催化作用，把有機物徹底氧化分解，產生二氧化碳和水，釋放能量，合成大量ATP的過程。
線粒體擁有自身的遺傳物質和遺傳體系，但其基因組大小有限，是一種半自主細胞器。除了爲細胞供能外，線粒體還參與諸如細胞分化、細胞資訊傳遞和細胞凋亡等過程，並擁有調控細胞生長和細胞週期的能力。
有氧呼吸分爲三個階段第一階段是葡萄糖在細胞質基質中分解成丙酮酸第二階段丙酮酸進入線立體，在線立體基質中水解出大量還原氫第三階段還原氫在線立體內膜跟氧氣結合，釋放大量能量因此有氧呼吸的主要場所在線粒體
