1、採集檢測樣本，如咽拭子或肛拭子。檢測樣本透過帶互鎖裝置及紫外線殺毒功能的傳遞窗進入到P3實驗室，可有效避免傳遞樣本時污染物的流通，不污染實驗室外環境。
2、樣本在水浴箱經半小時56攝氏高溫滅活，使病毒蛋白喪失生理活性，不再具備感染、發病和繁育的能力。
3、在標本採集處理間，實驗員取得滅活後的樣本時，首先進行震盪，接着開蓋加樣。樣本在開蓋轉移的過程中，病毒很容易曝露在實驗室的空氣中，與實驗員基本上是零距離接觸。
4、人工核酸提取流程繁雜，雖可以使用儀器輔助，但由於比對的需要，往往要加以人工操作，這需要反覆進行離心、加試劑、洗滌等10多個步驟。
5、提取的核酸送至核酸檢測室內，就需要上儀器設備了。把提取的核酸加入到擴增試劑中，透過熒光PCR儀進行RT PCR反應，將提取的核酸逆轉錄成DNA，再以DNA爲模版，對特定位點進行擴增，利用不同的溫度進行變性、退火和延伸，對每個循環採集熒光值，45個循環後繪製熒光曲線，用時約110分鐘，實驗員根據熒光曲線分析判斷結果的陰性和陽性。
