首先，安裝防垢器產品，防垢劑是去馬桶除水垢的出色工具。擔心結垢的家庭可以在水箱的供水管中安裝防垢飲用水阻垢劑。這將防止在智能坐便器蓋板在加熱水源時形成水垢。這樣的做法還可以軟化原始污垢以達到清洗的作用。
其次，將一杯白醋，再加上少許蘇打粉調勻倒在馬桶內，等候十至十五分鐘，便用長柄刷擦去污漬，然後放水沖洗即可。勿使用揮發劑、稀釋劑或其它化學物清洗，否則會腐蝕表面。勿使用鋼絲刷、刀片等鋒利器物清潔，會刮傷釉面。
最後，可以用白醋，但更建議檸檬酸，檸檬酸正常狀態是晶體顆粒狀，除花灑水垢時，要倒入適量顆粒到水中溶解，然後把花灑浸泡其中，根據污垢程度浸泡半小時到數小時不等。浸泡完的水垢會自動脫落，讓馬桶光亮如新。
