基層醫療機構一般情況下是指最小的行政區劃級別的醫療機構。現在的基層從廣義上來講是指縣一級的醫療機構和小型社區衛生醫療站（或者醫療救助中心）。現機構的大致定位是：縣級醫院爲龍頭、鄉鎮衛生院爲骨幹、村衛生室爲基礎。其中，鄉鎮衛生院負責提供公共衛生服務和常見病、多發病的診療等綜合服務，並承擔對村衛生室的業務管理和技術指導等工作村衛生室承擔行政村的公共衛生服務及一般疾病的診治等工作。有條件的農村可以實行鄉村一體化管理。
基層醫院一般是指一級醫院及以下等級的醫療機構（如：鄉鎮衛生院、村衛生室和社區醫院）。根據國家衛生部《醫院分級管理辦法（試行草案）》第四條，醫院按功能、任務不同劃分爲一、二、三級。
一級醫院：是直接向一定人口的社區提供預防、醫療、保健、康復服務的基層醫院、衛生院。
二級醫院：是向多個社區提供綜合醫療衛生服務和承擔一定教學、科研任務的地區性醫院。
三級醫院：是向幾個地區提供高水平專科性醫療衛生服務和執行高等教學、科研任務的區域性以上的醫院。
