1、商家不同
京東自營可以理解爲消費者是跟京東在做買賣，採用B2C的銷售模式，即商家直接到客戶的模式，採購產品的發票是由京東公司開具直營店，是京東提供平臺給廠商，廠商與消費者透過京東提供的平臺進行交易，商家給消費者開具的發票就不是京東的了另外，商家還需要給京東繳納一定的平臺使用費。
2、物流和發貨不同
京東自營是由京東倉庫發貨（京東目前在全國有八個京東倉庫）。簡單理解就是京東用批發價向商家拿貨，先放到京東倉庫中，然後在平臺進行銷售。客戶下單後，由距離客戶最近的倉庫發貨。直營商家則是由第三方賣家發貨，客戶下單後，商家自己發貨，與淘寶類似當然直營也可以選擇京東物流，但是發貨就不是透過京東倉庫來了。
京東自主品牌是京東投資創建的全品類商品，而京東自營是京東負責商品的管理運營，商家負責售後，這兩者的區別是一個是自己所有，一個是商家生產
一個意思，一般官方說法就是京東自營，就是指京東自己售賣的產品，然後透過自己的京東快遞即日達配送，和自主的是一個意思。
