Hpv疫苗二價、四價和九價的區別，主要是針對病毒亞型的種類和數量。HPV病毒有許多的亞型，至少還有30種與生殖道的黏膜感染有關係，其中還有高危型和女性的宮頸癌發生有密切的關係，特別是HPV16和18。
二價疫苗就是針對16和18亞型的，四價疫苗除16和18型以外，還增加了6和11型。
九價疫苗除四價的HPV疫苗以外，還包含其他的亞型，例如31、33、45、52和58的HPV。
二價疫苗可以預防70%以上的宮頸癌，四價疫苗可以預防70%以上的宮頸癌和90%以上的生殖器疣，九價疫苗可以預防90%以上的宮頸癌和生殖器疣。
