瓜達爾港屬熱帶沙漠氣候，年平均氣溫爲26.9℃，最熱月爲5—7月，最冷月爲1月。瓜達爾港氣溫年較差、日較差分別爲12.5℃和6.5℃，各季節間氣溫差異較小。其極端高溫達42.7℃，極端低溫爲11.9℃。
瓜達爾港年平均氣壓爲1 009.1 hPa，氣壓最大值出現在12月和1月，最小值出現在7月，季節差異明顯。
瓜達爾港受制於副熱帶高壓，常年乾旱少雨，降水年季之間分佈不均，差異明顯。2018年年降水量爲0.3 mm，集中於冬季 2019年年降水量爲67.6 mm，主要集中於秋冬兩季。相對溼度和水汽壓年均值分別是67.3%和24.3 hPa。
瓜達爾港年平均風速爲2.4 m·s-1，白天風速大於夜晚風速。四季中春季風速偏大。
