大結局在諸多人證物證面前，玉帝下旨，下令查處睚眥一夥的罪行，狴犴上殿與東海龍王相認，並表示以後願追隨媽祖，不願再會龍宮。睚眥、蚌妃等人獲罪，被押往斬龍臺和斬妖臺，珍王妃被打入冷宮。
此時，吳宗倫率衆與敵決戰，將敵兵逼退至順風島上，敵兵調來炮火增援，使宋軍受挫。吳宗倫戰死疆場，媽祖出現，大義凜然，勸退敵兵，我軍順利收復失地。吳宗倫被敕封爲抗敵英雄，媽祖則被封爲護國夫人。
媽祖帶領自己的水闕仙班成員終日巡邏予海上，救人予爲難。千百年來，媽祖護國佑民，搶險救人，降妖伏魔，懲惡揚善，爲民造福的傳說廣爲流傳，深入人心。她的功德與美名倍受百姓，皇帝及外國友人的禮讚。
