有區別。農業農村局是政府行使農業農村工作的職能部門，負責農業生產、農村發展、鄉村振興、科技種田、農業技術推廣、農作物病蟲害防治、高標準農田治理等等工作職能。
農水局是省級水利廳的下屬單位，職能職責是負責全省小農水項目的規劃、建設、管理、技術指導等等工作職能。
農業農村局和農水局區別
農業農村局是國家各級政府專業主管主抓與農村農民有關的政策事務工作，農水局我沒聽說過，我知道水利局和水務局，我想農水局是不是更具體了，專門去抓農村水利方面的事務，例如農村人們的吃水問題，莊稼的澆灌問題，還有農村地下水開採等等。
