1、 提交審計報告
首先，稅務局會讓你提交審計報告，這個報告你要找會計師事務所來出，主要清算報告和所得稅彙算清繳的報告，這個報告分保留意見和無保留意見，如果是小企業的註銷，審計報告是無保留意見，沒有什麼大額的欠款、往來和存貨，一般稅務局會不查帳就讓你過了。
2、 查增值稅帳
主要看你公司前期的增值稅申報是否正確，有沒有前期欠繳的增值稅，有沒有本期還沒有報的增值稅，增值稅發票是否完整，有沒有丟失。
3、 查存貨款
檢視公司有沒有存貨帳，這些存貨要麼在註銷前銷售並開具增值稅發票，如果在查帳時還有存貨，那稅務局就會要求做進項稅額轉出，把之前存貨抵扣了的進項稅在帳務上進行轉出，並要在當期的增值稅申報表上體現。
4、 查往來帳
稅務局會查往來帳，特別是金額比較大的往來帳和欠款，有沒有往來的憑據，比如借款合同、打款的銀行回單等等，稅務局查這個主要是查你有沒有隱瞞的收入或沒有開發票的收入。
5、 查所得稅
稅務局查所得稅主要查有沒有前期欠繳的所得稅，當期的所得稅有沒有繳成本費用中有沒有白條入帳的，也就是沒有發票的費用入帳，沒有發票的費用入帳要在所得稅彙算清繳中調增有沒有大額的營業外支出，這些營業外支出在稅務局備案沒有，有沒有稅務局備案和同意稅前扣除的材料，如果沒有，營業外支出要在所得稅彙算清繳中調增。
6、 地稅局查帳
地稅局查帳主要是查和地稅有關的帳，比如印花稅有沒有交，個人所得稅有沒有交，工會經費有沒有交，殘保金有沒有交等等。在註銷之前自己先清理下，該補繳的就補繳，查帳時應該沒什麼問題就透過了。
擴展資料：
公司註銷稅務如何查賬：
1、 現在的稅務局，一般都要求先出註銷清算報告，彙算清繳報告，這些報告都是找事務所出的，上面會有保留意見或者無保留意見，正常來說國稅看你沒有欠稅或者很大數額的不明賬款，都會讓你註銷的了。
2、地稅相對比較麻煩，要查你的註冊資本金印花稅有沒交，賬本印花稅之類的。把這些稅都補齊了，沒有什麼其他應收應付，無法解析的大額往來的話，基本上也會讓你透過的了。如果有的話就要你逐步補充解析材料，合情合理的一般沒問題，解析不了的就按營收補稅，補完也就透過了。
3、一般稅局專管員批覆之前都會讓你把電子賬，報表這些上傳到報稅的網站。大概也會瀏覽一下每月報表，看看有沒有一些很突兀的數字的。
