一：專業方向不同
簡而言之，畜牧獸醫專業是研究給動物治病的，動物醫學專業是研究動物疾病形成，診治保護，製藥，防疫等。動物醫學專業涵蓋的範圍更爲廣泛。
畜牧獸醫專業培養具備畜牧獸醫的基本知識與技術技能，能從事畜禽管理與疾病診治工作的進階技術應用型專門人才。
動物醫學專業分重點研究動物疾病發生髮展、動物疾病診斷和治療、環境與動物保護、動物藥物和生物製品生產和公共衛生防疫等。
二：培養目標不同
畜牧獸醫專業主要培養的是掌握動物營養與飼料、畜禽環境衛生、動物遺傳繁育、畜禽飼養管理及疾病診療基本知識，具備畜禽飼養管理、選種繁殖、日糧配合和畜禽主要疾病的預防及診療能力，從事畜禽的日糧配合、飼料加工、環境調控、繁殖改良、飼養管理、疾病防治等工作的高素質技術技能人才。
動物醫學專業的學生主要學習動物基礎醫學、預防醫學和臨牀醫學的基本理論和基本知識，受到動物體正常和異常結構及功能實驗、檢查、疾病預防、診斷、治療技術的基本訓練，具有動物保健、臨牀診療、動物防疫檢疫和獸醫衛生管理工作的基本能力。三：就業方向不同
畜牧獸醫專業就業主要面向規模化畜禽養殖、飼料加工與銷售、基層畜牧善醫等企業，在畜牧生產、管理、技術服務和營銷崗位羣，從事畜禽養殖與繁育、飼料加工與營銷、疫病診斷與防治等工作。
動物醫學專業的學生畢業後可從事畜牧獸醫行政管理、進出口動物及其產品的檢驗、肉品衛生檢驗、飼料工業、食品安全、環境保護、畜禽疾病的診斷與防治、動物醫療保健、公共衛生及生物學領域等方面的工作。
