原生物种又称本土物种。在生物学中，若一物种被认为是“原生物种”，表示其在该地的分布纯粹是自然因素造成的，没有人为因素夹杂其中。
每种野生生物都有一定的自然分布范围，在该范围内，该生物被视为是原生物种。物种有可能因人类活动而散布到原生范围之外，在这些区域该物种就会被视为外来物种。
原生生物，包含于最简单的真核生物。全部生活在水中，没有角质。可分为三大类，藻类、原生动物类、原生菌类。它们的细胞内具有细胞核和有膜的细胞器。比原核细胞更大、更复杂。有些原生生物可以利用光合作用制造食物，原生生物界至少包含5万种的生物。
