塔克拉瑪干沙漠河流分佈圖

塔克拉瑪干沙漠有許多河流注入流沙地區，像塔里木河、葉爾羌河、車爾臣河、和田河、克里雅河等，有的河流竟縱穿沙漠而過。這些河流大都發源於塔里木盆地南部的崑崙山、喀喇崑崙山和北部的天山。由於水源豐沛，河流兩岸的谷地蘊含著水質優良、水量充足的地下水，有的地方泉水溢位，形成許多零星的小湖。