固態硬碟建議格式化成NTFS檔案系統，原因基於以下幾點：
1、固態硬碟的最主要的特點就是讀寫速度快，所以常常被用來安裝作業系統。目前NTFS已經成為微軟主流作業系統的限制級專用的檔案系統。在微軟的主流作業系統中，作業系統所在的碟符的檔案系統必須格式化為NTFS的檔案系統，所以如果要用固態硬碟當做系統盤，就必須使用NTFS檔案系統。
2、NTFS檔案系統在資料上的功能也很強大，它提供長檔名、資料保護和恢復，並通過目錄和檔案許可實現安全性，所以資料盤的檔案系統選擇NTFS具有更強安全性。
3、因為NTFS檔案系統的使用廣泛，其它的非Windows作業系統也是支援NTFS檔案系統的，它具有良好的相容性和跨平臺性。
FAT32雖然有著最廣泛的平臺相容性，但讀寫效能相對較差。
exFAT無法應用於系統盤，只能用於普通資料硬碟。
