補水路徑分為四條，其中:南水北調東線一期北延工程經小運河、六分幹、七一河、六五河為南運河補水，補水量1.83億立方米，全部入京杭大運河
嶽城水庫經漳河向衛運河、南運河補水，補水量2.0億立方米，入京杭大運河1.62億立方米潘莊引黃經潘莊引黃渠首、潘莊總乾渠、馬頰河、沙楊河、頭屯乾渠、漳衛新河倒虹吸，向南運河補水，補水量0.3億立方米，入京杭大運河0.24億立方米
密雲水庫經京密引水渠、溫榆河等向北運河補水，補水量0.3億立方米，入京杭大運河0.25億立方米。再生水及其他水源補水0.72億立方米，全部入京杭大運河。
各補水水源同時為途徑的溫榆河、漳河、隋唐運河、衛千乾渠、潘莊總乾渠、七一河、六五河等河流補水，補水線路總長約1230公里(含貫通補水河長707公里)，涉及沿線41個存在地下水超採問題的縣，面積達2.97萬平方公里。
