1、概念不同
自营店是指专门经营或授权经营某一主要品牌商品（制造商品牌和中间商品牌）为主的零售业形态。
企营店是指由总公司直接经营的连锁店，即由公司总部直接经营、投资、管理各个零售点的经营形态。总部采取纵深似的管理方式，直接下令掌管所有的零售店，零售店也必须完全接受总部指挥。
2、法律关系不同
企营店主要是指所有权属于公司并且由公司自己管理。自营店一般来讲是指公司为了扩大自己在各个区域的市场，开几家或更多的直营店，我们讲的专卖店实质也应当是一种直营店，简单讲，多家企营店就是专卖店喽，在所有权上理所当然属于公司了，一般来说，专卖店有着统一的CI。
3、特点不同
专卖店是公司品牌、形象、文化的窗口，有利于公司品牌的进一步提升能有效贯彻和执行公司文化及活动方针，有效提高集团的执行力，突破现代企业所普遍面临的管理瓶颈
专心专业、专卖公司品牌，大大增强公司产品的终端销售能力，更多的创造顾客购买公司系列产品的机会，提升公司产品的销量。
销售、服务一体化，可创造稳定的忠诚的公司顾客消费群体易于及时向终端经销商和消费者提供公司的产品信息，同时易于收集市场和渠道信息消费者到专卖店选购产品时，公司有百分之百的销售机会，大大增加了公司产品的成交率。
直营连锁的所有权和经营权集中统一于总部。其所有权和经营权的集中统一表现在：所有成员企业必须是单一所有者，归一个公司，一个联合组织或单一个人所有。
由总部集中领导、统一管理，如人事、采购、计划、广告、会计和经营方针都集中统一实行统一核算制度各直营连锁店经理是雇员而不是所有者各直营连锁店实行标准化经营管理。
