導致蔬菜幼苗栽下萎蔫的原因很多，既有生理性的，也有病理性的。
1 供水不足
秋茬蔬菜定植期正值高温乾旱季節，土壤水分蒸發快，植株蒸騰作用強，如果供水不足，植株散失的水分大於吸收的水分，就會出現萎蔫。菜農朋友不可為了蹲苗而一味控水，一般6-7天澆一遍水即可。
2 閃苗
閃苗是由於水分散失過快引起的，一般出現在連陰天驟晴時。連續陰雨天光照弱，植株光合產物不足，根系吸收能力下降，天氣突然轉晴時，光照強烈，温度迅速上升，很容易導致全棚蔬菜萎蔫。
遇到連陰天轉晴時，要給蔬菜幼苗一個適應過程，控制通風，覆蓋遮陽網遮陰，逐步增加見光，提高温度，避免環境劇烈變化導致萎蔫。若幼苗已經出現萎蔫，應及時噴灑清水，緩慢調節水分吸收與散失的平衡。
3 根系受傷，吸水不良
根系是植株吸收水分的主要器官，若根系出現問題，水分吸收必然會受到影響。因此，在蔬菜發生萎蔫時，應重點查看根系是否出現問題。秋茬蔬菜定植後，導致蔬菜根系受傷的原因主要有漚根、燒根、根部病害和地下害蟲幾種，菜農一定要分清原因，對症下藥。
1、 漚根
大水漫灌或澆水後遇連陰天，土壤含水量過高，透氣性差，時間長，植株根系呼吸困難，無氧呼吸時產生的乙醇等有害物質積累損傷根系，從而導致植株萎蔫。
建議菜農起壟栽培，避免溝栽或畦栽澆水時應避免大水漫灌，不能出現積水勤劃鋤，增加土壤透氣性。
2、 燒根
有機肥未充分腐熟或使用的化肥距離植株根系太近、數量太大時，都會導致燒根。因此雞糞、鴨糞等有機肥一定要腐熟後再定植，或直接選用商品有機肥
土壤不能僅用旋耕機翻地，否則會導致肥料集中於地表10釐米以內，更容易出現燒根。對於肥害造成的植株萎蔫，可立即澆水壓鹽、衝施生物菌肥進行緩解。
3、 根部病害
蔬菜出現萎蔫，應先確定是否發生根部病害，初步判斷標準是單棵發生、點狀分佈，然後拔出看根系是否出現病變，及時對症用藥。
常見的根部病害有腐皮鐮孢根腐病、疫黴根腐病、擬莖點黴根腐病、枯萎病、青枯病、根結線蟲等。
4、 地下蟲害
常見的地下害蟲有蠐螬、螻蛄、地老虎、根蛆等，這些地下害蟲咬食植株根系，導致植株脱水萎蔫。高温悶棚可有效控制地下害蟲為害。
