一、分布不同
1、芝麻剑：分布于中国钱塘江、九龙江、韩江、珠江、元江等水系。
2、钳鱼：主要产于长江和珠江流域。
二、外形特征不同
1、芝麻剑：体长，侧扁。头平扁，吻宽而圆钝，略似犁头状。口宽大，下位，弧形。上、下颌齿带弧形，腭骨齿带略呈半环形，齿绒毛状。唇厚，下唇中间不连续。两鼻孔略近，前鼻孔管状，后鼻孔前缘有鼻须。
2、钳鱼：周身无鳞、体表多黏液、头扁口阔、上下颌各有4根条胡须。
三、生活习性不同
1、芝麻剑：栖息于江河的底层，以小型水生动物为食，如水生昆虫、小鱼、小虾等，也食少量的高等水生植物碎屑。每年4-6月繁殖，但在6-8月也发现有成熟个体。
2、钳鱼：钳鱼为底层凶猛性鱼类。怕光，喜欢生活在江河近岸的石缝、深坑、树根底部的土洞或石洞里，以及流速缓慢的水域中
